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年，置五军十卫参军府，设左、右参军。洪武十七年公元1384年，五军各设左、右断事2人，提控案牍1人，并从九品。二十三年公元1390年，升五军断事官为正五品，总治五军刑狱。分为五司，每司设稽仁、稽义、稽礼、稽智、稽信5人，均为正七品，各理其军之刑狱。同时，朱元璋为了防范统军将领的专权，又规定五军都督府对军队无调遣权，其调遣之权由皇帝直接掌管；兵部在军队中虽有任免、升调、训练之权，但不统兵。每逢战事，由皇帝临时委派专人担任总兵官，统率卫所部队出征，战事结束，总兵归还将印，军队归还卫所。兵权始终掌握在皇帝手中，这是朱元璋从军事上加强和巩固皇权的重要措施。
在京各卫，称为京卫。京卫有上直卫，南京卫，北京卫，品秩相同。各有掌印、佥书。上直卫的亲军指挥使司有26个卫，即锦衣卫、旗手卫、金吾前卫、金吾后卫、羽林左卫、羽林右卫、府军卫、府军左卫、府军右卫、府军前卫、府军后卫、虎贲左卫以上12卫，洪武中置，金吾左卫、金吾右卫、羽林前卫、燕山左卫、燕山右卫、燕山前卫、大兴左卫、济阳卫、济州卫、通州卫以上10卫，永乐中置、腾骧左卫、腾骧右卫、武骧左卫、武骧右卫以上4卫，宣德八年置。其中锦衣卫掌侍卫，缉捕，刑狱之事，常以勋戚都督领之，恩荫寄禄无常员。凡朝会，巡幸，则具卤簿仪仗，率领大汉将军共1，507员等侍从扈行。宿卫则分番入直。锦衣卫名为宿卫扈从，实则假侦事之权，以欺压平民及一般官员，最为专横跋扈，特异于其他各卫。
留守5卫：旧为都镇抚司，总领禁卫，先属于中书省，后改隶大都督府，设都镇抚从四品，副镇抚从五品，知事从八品。旋即改称宿卫镇抚司，设宿卫镇抚，宿卫知事。洪武三年公元1370年改留守卫指挥使司，专领军马守御各城门，及巡警皇城与城垣造作之事。后升为留守都卫，统辖天策、豹韬、飞熊、鹰扬、江阴、广洋、横海、龙江、水军左、右10卫。洪武八年公元1375年，复为留守卫，与天策等8卫，俱为亲军指挥使司惟水军左右卫为指挥使司并隶大都督府。洪武十一年公元1378年改为留守中卫，增置留守左、右、前、后4卫，仍为亲军。洪武十三年公元1380年始分隶五都督府。
南京另有一套军职：
南京设守备1人，协同守备1人，参赞机务1人。守备，以公、侯、伯充任，兼领中军都督府事。协同守备，以侯、伯、都督充之，领五府事。参赞机务，以南京兵部尚书领之，其治所在中府，掌南都一切留守、防护之事。
南京五都督府为：左、右都督，都督同知，都督佥事，不全设。其掌印、佥书，皆以勋爵及三等都督充任。分掌南京卫所，以达于南京兵部。
南京卫指挥使司，王府护卫指挥使司：设官皆如北京卫司。
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更新时间:2009315 19:07:38 本章字数:7658
明代地方区域的划分，除南、北两京外，还有十三个布政司，明之布政使司是由元代行中书省演化而来的，明史职官志四载：
洪武九年公元1376年改浙江、江西、福建、北平、广西、四川、山东、广东、河南、陕西、湖广、山西诸行省俱为承宣布政使司，罢行省平章政事、左，右丞等官。改参知政事为布政使十五年公元1382年置云南市政司永乐元年公元1403年，以北平布政司为北京十一年公元1413年置贵州布政司宣德三年公元1428年除两京外，定为十三布政司。
承宣布政使司，设左、右布政使各1人从二品，左、右参政从三品，左、右参议，无定员从四品。参政、参议因事而添设，各省不等。经历司，经历1人从六品，都事1人从七品。照磨所，照磨1人从八品、检校1人正九品。理问所，理问1人从六品、副理问1人从七品、提控案牍1人。司狱司，司狱1人从九品，库大使1人从九品，副使1人、仓大使1人从九品、副使1人。杂造局、军器局、宝泉局、织染局，各大使1人从九品、副使1人。
布政使是一省最高的行政长官，掌一省之政，朝廷有德泽、禁令、承流宣播，下达于有司。凡僚属满秩，负责考察其称职与不称职，上报达吏部、都察院。每三年则率其府、州、县正官，朝觐京师，以听察典。参政、参议分守各道，及派管粮储、屯田、清军、驿传、水利、抚民等事。经历、都事负责文书往来。照磨、检校、典勘理卷宗，理问典刑名。
明初置提刑按察司，洪武十四年公元1381年，于各道置按察分司。十五年公元1382年，又在府州县置按察分司。建文时，改为十三道肃政按察司，每司设按察使1人正三品、副使正四品、佥事无定员正五品。经历司，设经历1人正七品，知事1人正八品。照磨所，照磨1人正九品、检校1人从九品。司狱司，司狱1人从九品。
按察使掌一省刑名按劾之事。纠官邪，奸暴，平狱讼，雪冤抑，以振扬风纪而澄清其吏治。副使、佥事，分道巡察，明史职官志四载，洪武十五年，以儒士王存中等531人为试佥事，每人按察二县，“凡官吏贤否，军民利病，皆得廉问纠举。”
又有都指挥使司，掌各省之军事。与布政使司、按察使司合称为“三司”。都、布、按三司鼎立之制，虽能防止地方权力之扩大，但又不免酿成运用不灵之弊。所以明中央又派遣监察御史或部院大臣出任总督、巡抚、巡按各差，以驾凌于三司之上。明史职官志二说：
其在外加都御史或副、佥都御史衔者，有总督、有提督、有巡抚，有总督兼巡抚，提督兼巡抚，及经历、总理、赞理、巡视、抚治等员。
“巡抚”之名即起于明代，据沈德符万历野获编记载，“洪武二十四年公元1391年辛未，太祖令皇太子即懿文太子巡抚陕西地方，巡抚之名，始见于此。”永乐十九年公元1421年遣尚书蹇义等26人巡行天下，安抚军民。此后，逐渐派一些尚书，侍郎，都御史，少卿等官去巡抚各处的边境腹地，办完事情就回朝廷复命。这样的官员，当时称为“巡抚”，或名“镇守”。巡抚兼军务的加提督，有总兵地方加赞理或参赞，所辖多而事务重者加总督。以尚书、侍郎任总督军务的，皆兼都御史，以便行事。由于总兵、宦官也可称为“镇守”，容易造成混乱，所以后来凡是文职官员奉命出朝，就一律称为“巡抚”，以与“镇守”相区别。此外，明代还派监察御史巡视各省，以资监察，称为“巡按”。“巡抚”、“巡按”略有不同，但这些都是明代才设置的差务。由于这些官职是临时性的，所以各处名称都不同。比较经常设置的，有总督漕运兼提督军务巡抚凤阳等处兼管河道1员，总督蓟、辽、保定等处军务兼理粮饷1员，总督陕西三边军务1员，总督两广军务兼理粮饷带管盐法兼巡抚广东地方一员，总理粮储提督军务兼巡抚应天等府1员，巡抚顺天等府地方兼整饬蓟州等处边备1员，巡抚保定等府提督紫荆等关兼管河道1员，巡抚南赣、汀韶等处地方提督军务1员。巡抚偏沅地方赞理军务1员，抚治郧阳等处地方兼提督军务1员。这些官员设置都是以边防或镇压人民为主要任务的。日久之后，便变成定制，到清代才将督抚看作一省的最高长官。总督在明代有称总制的，所以清代一般还称总督为制台。而督抚仍用钦差官的体制，不给印绶而给关防，称部堂、部院，而不单称总督，巡抚。